communauté d'organismes en interaction avec un environnement particulier.

 perte d'une variation génétique lorsqu'une nouvelle colonie est formée par un très petit nombre d'individus à partir d'une population plus importante.

 processus intervenant pendant la méiose, au cours duquel les chromosomes d'une paire diploïde échangent des matériaux génétiques visibles au microscope classique. Il engendre la recombinaison sur le plan génétique.

 protéine agissant comme catalyseur dans des réactions chimiques.

 deuxième temps des cinq grandes ères de la période tertiaire, de - 54 à - 38 millions d'années. C'est une époque connue pour l'apparition des mammifères.

 interaction des gènes dans deux loci ou plus, le phénotype différant de celui que l'on pourrait obtenir si les loci s'exprimaient de façon indépendante.

 échelle utilisée pour décrire des événements survenus dans l'histoire de la terre.

 catégorie de classification importante pour lesquelles il existe plusieurs théories : concept de l'espèce biologique, concept de l'espèce cladistique, concept de l'espèce écologique, concept de l'espèce reconnaissante. Le concept de l'espèce biologique, qui se fonde sur le postulat qu'une espèce est un ensemble d'organismes qui se croisent, est la définition la plus courante, ou tout au moins celle qui est la plus largement utilisée par les biologistes qui étudient les vertébrés. Les espèces particulières sont désignées par un binôme linnéen, comme par exemple Homo sapiens pour les êtres humains.

 théorie qui postule qu'une espèce est un ensemble d'organismes qui se reconnaissent mutuellement comme compagnons potentiels; ils partagent un système de reconnaissance. Voir espèce cladistique, espèce écologique et espèce phénétique.

 science ou modification d'une population, tout particulièrement d'humains, par la reproduction contrôlée dans le but de transmettre héréditairement les caractéristiques recherchées. Ce terme a été inventé en 1883 par Francis Galton, partisan de "l'amélioration" de la race humaine  par la modification de la fertilité de certaines catégories de personnes. L'eugénisme est tombé en disgrâce après que les Nazis eurent dévoyé ses théories.

 Darwin définit ce terme comme la "transmission accompagnée d'une modification". Il s'agit du changement observé dans une lignée de populations entre générations. Globalement, l'évolution biologique est le processus de changement au cours duquel de nouvelles espèces se développent au fil du temps à partir d'espèces préexistantes; en termes génétiques, l'évolution peut se définir par tout changement de fréquence des allèles dans des populations d'organismes d'une génération à l'autre.

 tendance des différents gênes dans une famille génétique à évoluer de concert; chaque locus de gêne de la famille présente la même variante génétique.

 évolution d'espèces à partir de groupes taxonomiques différents vers une forme similaire; développement de caractéristiques similaires chez des organismes différents sur le plan taxonomique.

 évolution engendrée par le processus de sélection naturelle avec des variations aléatoires.

 catégorie de classification taxonomique entre l'ordre et le genre (voir taxon). Les organismes dans une famille présentent de fortes similitudes. On citera pour exemple les félins, qui comprend les lions et les chats domestiques.

 période durant laquelle les animaux portant des petits vivants (surtout les mammifères), de la fécondation de l'œuf et de son implantation dans la paroi de l'utérus jusqu'à la naissance du petit (parturition), et au cours de laquelle le jeune se développe dans l'utérus. Chez les êtres humains, la gestation est appelée grossesse et dure environ neuf mois (40 semaines).

 formation de grandes plaques de glace à terre. La glaciation des continents marque le début de l'ère glaciaire, et entraîna une modification considérable de l'apparence de la terre et des organismes qui la peuplaient.

 ensemble d'espèces regroupant un ancêtre commun et tous ses descendants, et ne contenant pas d'organismes ne descendant pas de cet ancêtre commun.

 ensemble d'espèces partageant une espèce ancestrale avec certains de ses descendants. Les espèces du groupe sont celles qui ressemblent encore à leur ancêtre, tandis que les espèces qui ne font plus partie du groupe ont évolué rapidement et ne ressemblent plus à leur ancêtre.

 ensemble d'espèces ayant en commun plus d'un ancêtre. Le dernier ancêtre commun de toutes les espèces du groupe n'est pas membre du groupe polyphylétique.

 se dit des organismes n'ayant qu'un seul jeu de gènes ou de chromosomes. Chez les organismes habituellement diploïdes comme les êtres humains, seuls les gamètes sont haploïdes.

 ensemble de gènes situés dans plus d'un locus, qu'un individu a hérité d'un de ses parents. C'est l'analogue multi-loci d'un allèle.

 théorie ayant fait date dans l'histoire mais erronée, qui postule qu'un individu hérite des caractères que ses parents ont acquis leur vie durant.

 synonyme erroné utilisé autrefois pour désigner la transmission des caractéristiques acquises.

 mode de transmission héréditaire de toutes les espèces diploïdes, et donc de la quasi-totalité des organismes pluricellulaires. L'hérédité est gouvernée par les gènes, qui se transmettent aux descendants sous la même forme que celle qui était la leur quand ils ont été transmis par la génération précédente. Sur chaque locus, un individu a deux gènes, l'un hérité de son père et l'autre de sa mère. Ces deux gènes se retrouvent dans les mêmes proportions dans ses gamètes.

 théorie très répandue autrefois mais erronée selon laquelle les organismes sont porteurs d'une combinaison de facteurs hérités de leurs parents et les transmettent à leurs descendants. S'oppose à hérédité mendélienne.

 caractère partagé par un ensemble d'espèces et présents chez leur ancêtre commun. S'oppose à analogie. Certains biologistes moléculaires, lorsqu'ils comparent deux séquences, emploient le terme "homologue" pour les sites correspondants si ceux-ci ont le même nucléotide, que la similitude partagée provienne sur le plan évolutif d'un ancêtre commun ou qu'elle soit convergente. Ces biologistes parlent également de pourcentage d'homologie entre deux séquences. A cet égard, homologie signifie seulement similitude. Cet usage est désapprouvé par un grand nombre de biologistes spécialistes de l'évolutionnisme, mais est très répandu dans la littérature moléculaire.

 homologie qui a évolué avant l'ancêtre commun d'un ensemble d'espèces et qui est présente dans d'autres espèces extérieures à cet ensemble d'espèces. Voir homologie dérivée.

 homologie apparue pour la première fois dans l'ancêtre commun d'un ensemble d'espèces et qui est propre à ces espèces. S'oppose à homologie ancestrale.

 intellectuel et photographe britannique contemporain de Darwin. Il fut le premier à appliquer la théorie de la sélection naturelle à l'humanité pour expliquer le déroulement de l'évolution humaine.

 descendant d'un croisement entre deux espèces.

 opération consistant à supprimer des gènes de l'ADN d'une espèce et à les introduire dans l'ADN d'une autre espèce en utilisant les techniques de biologie moléculaire.

 événement (ou produit de l'événement) au cours duquel une séquence de nucléotides de l'ADN est renversée ou inversée. Il arrive que les inversions soient visibles dans la structure des chromosomes.

 deux populations ou individus de sexe opposé sont réputés être isolé(e)s l'un(e) de l'autre sur le plan reproductif si elles ou ils n'arrivent pas à produire des descendants féconds. Voir isolement prézygote et isolement postzygote.

 naturaliste, zoologiste et botaniste du 18ème siècle connu pour son étude et sa classification des invertébrés ainsi que pour ses théories sur l'évolution. Il fit de nombreux voyages dans toute l'Europe, et fut élu à l'Académie des Sciences, où il présenta la théorie de l'hérédité et des caractéristiques acquises.

 portion de sol divisée en territoires défendus par des mâles qui les exposent aux femelles pendant la saison d'accouplement. Ce type de comportement d'accouplement est connu sous le nom de "lekking", et s'observe chez plusieurs espèces d'oiseaux (notamment le paon) et chez certains mammifères. Les mâles dominants occupent les territoires au centre du lek, là où ils ont le plus de chances d'attirer les femelles et de s'accoupler avec elles. Les territoires extérieurs sont occupés par les mâles subalternes qui ont moins de possibilités de s'accoupler. Après plusieurs saisons successives d'accouplement, les jeunes mâles subalternes délogent progressivement les mâles plus âgés des territoires les plus convoités et deviennent dominants à leur tour. Les territoires du lek ne contiennent pas de ressources précieuses pour les femelles telles que la nourriture ou les matériaux nécessaires à la confection d'abris pour les portées, bien que dans certaines espèces, les mâles construisent parfois des structures ressemblant à des abris et dont ils se servent pour parader.

 on emploie ce terme dans les situations où les fréquences haplotypes dans une population s'écartent des valeurs qui seraient les leurs si les gènes de chaque locus se combinaient de façon aléatoire (lorsqu'il n'y a pas de déviation, on dit que la population a une liaison équilibrée).

 séquence descendant d'un ancêtre de (1) populations, (2) cellules ou (3) gènes.

 emplacement occupé par un gène particulier dans l'ADN.

 on dit d'un comportement qu'il a une logique adaptative s'il résulte en une augmentation du nombre de descendants qu'un individu donne à la prochaine génération et aux générations suivantes. Si ce comportement est déterminé génétiquement, même si ce n'est que partiellement, il aura tendance à se répandre au sein de la population. Ensuite, même si les circonstances changent au point où ce comportement ne présente plus d'avantage sur le plan de la survie ou de la reproduction, il perdurera, à moins qu'il ne se mette à présenter de nets inconvénients dans le nouvel environnement.

 hypothèse erronée en tout ou partie selon laquelle un individu passe au cours de son développement par plusieurs stades qui correspondent à ses ancêtres successifs dans l'évolution. Selon les hypothèses de la loi biogénétique ou récapitulation ontogénétique, un individu évolue en "grimpant dans l'arbre généalogique".

 scientifique du 19ème siècle considéré comme le père de la géologie moderne. Lyell avança l'hypothèse que la géologie de la terre est façonnée par des processus graduels, comme l'érosion et la sédimentation. Lyell exposa ses théories dans son ouvrage phare intitulé "Les principes de la géologie" (Principles of Geology), largement influencé par le jeune Charles Darwin. Darwin et Lyell devirent par la suite des amis proches. Alors que Lyell réfutait au départ la théorie évolutionniste, il finit par s'y rallier après la publication de l'ouvrage de Darwin intitulé "De l'origine des espèces".