Faction dissidente du FPLP, créée et dirigée par Ahmed Djibril dès 1968. Son quartier-général se situe à Al-Rihan, une base des services de renseignements des forces aériennes syriennes, dans la banlieue de Damas (Syrie), et il exploite un poste de commandement opérationnel à Deïr Znun, au Liban. Ses effectifs sont évalués à 500-800 activistes.

En 1959 déjà, Ahmed Djibril fonde le Front de Libération de la Palestine (FLP), qui mène ses premières attaques contre Israël en 1965. En 1967, le FLP fusionne avec le FPLP de Georges Habache. Mais, alors que ce dernier voit la lutte également sous un angle politique, Djibril prône l'action militaire pure. De ces tensions résulte la séparation des deux mouvements et ainsi est créé le FPLP-CG en 1968. Membre de l'Organisation de Libération de la Palestine (OLP), le FPLP-CG s'oppose de manière systématique à l'orientation politique donnée á la lutte palestinienne par Yasser Arafat, et se retire progressivement du Conseil Exécutif de l'OLP et du Comité Central. Il se soumet néanmoins à la décision du Conseil National Palestinien - auquel il continue de participer - de juin 1974 d'abandonner le terrorisme international.

En 1976, le soutien de Djibril à la politique syrienne au Liban provoque le départ d'un groupe dirigé par Mahmoud Zeïdan, qui forme le Front de Libération de la Palestine avec le soutien de l'Iraq l'année suivante.

En 1983, le Fatah est l'objet d'une rébellion interne menée par des éléments radicaux opposés au processus politique de Yasser Arafat. La Syrie soutien Abou Moussa et Djibril rompt avec l'OLP. Mais le mouvement n'est pas monolithique et un groupe de 100-150 activistes, dirigé par Abou Jabar (ancien chef de la sécurité) rejoint l'OLP.

En 1985, le Fatah - Commandement Provisoire d'Abou Moussa et le FPLP-CG rejoignent le Front de Salut National Palestinien (FSNP).

Dès 1988, les efforts d'Arafat pour essayer de contenir l'insurrection dans les territoires occupés et sa reconnaissance des résolutions 242 et 338 des Nations Unies, consomment la séparation entre Djibril et l'OLP.

Jusqu'en 1989, le FPLP-CG entretient des relations avec la Libye, où il entretient des bases. Expulsé de Libye, le FPLP-CG s'installe en Syrie et au Liban dès 1990.

Au début des années 90, le FPLP-CG a un centre d'instruction au " Camp du 17 septembre " à 'Aïn es-Sabaa (Syrie), et des camps à Al-Rihan (Syrie) et Ad Damur (Liban).

Durant les années 70, le FPLP-CG s'est spécialisé dans les attentats aux lettres piégées. Il a pratiqué des attaques non-conventionnelles en passant la frontière israélienne avec des ballons à air chaud et des ultra-légers motorisés (ULM) acquis en France, avec l'aide des services de renseignements syriens.